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最近、すごいものを発見しました!彼の周りの高度な実験の専門家の多くは、非常に基本的な実験の知識さえ知りません。

たとえば、次の質問に答えられますか?

OD260とA260に違いはありますか?それぞれどういう意味ですか?
OD は光学密度 (光学密度) の略語で、A は吸光度 (吸光度) の略語で、この 2 つの概念は実際には同じであり、「光学密度」は「吸光度」ですが、「光学密度」はほとんどの国家基準と一致しており、より標準化されています。

通常、核酸濃度を計算するために 260nm で OD 値を測定しますが、1OD は何を表すのでしょうか?
核酸は波長 260nm に最大吸収ピークを持ち、これには DNA と RNA の両方と、断片化された核酸断片が含まれます (これが重要なポイントです)。
波長260nmで測定したOD値をOD260として記録した。サンプルが純粋な場合、OD260 値から核酸サンプルの濃度を計算できます。
1 OD260=50 μg/ml dsDNA (二本鎖 DNA)
=37 μg/ml ssDNA (一本鎖 DNA)
=40μg/ml RNA
=30 μg/ml dNTP (オリゴヌクレオチド)
RT-PCR、リアルタイム PCR、QPCR の間には関連性や違いはありますか?
RT-PCRはReverse Transcription PCRの略です
リアルタイム PCR=qPCR、定量的リアルタイム PCR の略称
Real Time PCR(リアルタイム蛍光定量PCR)とReverse Transcription PCR(逆転写PCR)は両方ともRT-PCRと略されるようですが。しかし、国際的な慣例では、RT-PCR は特に逆転写 PCR を指します。

生物学において DNA/RNA の長さを表すために一般的に使用される nt、bp、および kb は何ですか?
nt = ヌクレオチド
bp = 塩基対 塩基対
kb = キロベース

もちろん、多くの人はそんな細かいことは気にしないと言えるでしょう。誰もがこれをやっているので、それが何なのか誰も尋ねません。これは不必要だということはわかっていますよね?

いいえ、いいえ、いいえ、これを知ることは非常に必要です。どれのためですか?
記事を投稿したいからです!兄弟!卒業を目指している場合でも、科学研究の成果を追求している場合でも、論文に頼って話す必要があります。

核酸抽出は最も単純かつ基本的な実験です。核酸抽出の品質は、その後の実験の結果を直接決定します。

何度も言いますが、それでも気にしない友達はたくさんいます。今回は記事から離れることにしました!

画像1
MIQE と呼ばれる定量的リアルタイム PCR 実験の公表のための最小限の情報は、国際的に発表された一連の蛍光定量実験ガイドラインであり、蛍光定量 PCR 実験の評価と論文の出版に必要な実験情報の最低限の基準を提案しています。実験者が提供する実験条件と分析方法を通じて、レビュー担当者は研究者の実験計画の妥当性をより適切に評価できます。
画像2
核酸抽出のセクションでは、次の検出項目が提案されていることがわかります。

「E」は必ずご提供いただく情報、「D」は必要に応じてご提供いただく情報を示します。

このフォームは非常に複雑です。実際、誰もが最初から始める必要があると言いたいのです。

純度 (D)、収量 (D)、完全性 (E)、一貫性 (E) の 4 つの側面で核酸を評価します。

実験の習慣に従って、最初に純度と濃度の評価方法について話します。

OD 測定は、実験者にとって最も人気があり、最も簡単な検出方法です。原則については、ここでは詳しく説明しません。現在、多くの研究室では超微量分光光度計を使用して核酸サンプルを直接定量分析しています。プログラムは吸光度値を表示しながら、濃度値 (核酸、タンパク質、蛍光色素) と関連する比率を直接与えます。OD 値の分析については、この画像を保存すれば問題ありません。

ユニバーサルOD値ソリューション一覧

画像3ただし、個別に説明する必要があるいくつかの注意事項があります。

(結局のところ、お金を貯めて必要になるまで待つのはあなた自身だとわかっています!)

注1 設備

OD 値はさまざまな機器の影響を受けます。OD260 が一定の範囲内にある限り、OD230 と OD280 の値は意味を持ちます。たとえば、一般的な Eppendorf D30 の 260nm での吸光度範囲は 0 ~ 3A ですが、Thermo の NanoDrop One は 260nm です。吸光度範囲は0.5〜62.5Aです。

注2希釈試薬

OD 値は、さまざまな試薬の希釈によって影響を受ける可能性があります。たとえば、pH における精製 RNA の OD260/280 測定値7.5 10mM トリスバッファは 1.9 ~ 2.1 の間ですが、中性水溶液比率は低くなり、おそらくわずか 1.8 ~ 2.0 ですが、これは RNA の品質が変化することを意味するものではありません。

注3残留物質

残留物の存在は核酸濃度測定の精度に影響を与えるため、核酸サンプル中にはタンパク質、フェノール、多糖類、ポリフェノールの残留物を極力避ける必要があります。

しかし、実際には、有機試薬による抽出は古い方法です。市販のキットでは、遠心分離と組み合わせたシリカベースの吸着カラムによって抽出効果が得られ、除去が困難な有毒で有害な有機試薬などを回避できます。Foregene の核酸抽出キットは、操作全体を通じて DNase/RNase や有毒な有機試薬を使用せず、迅速かつ安全です。, そしてその効果は良い(うっかりハゲだと言ってしまいましたが、知りたいのはわかります)。

例 1: ゲノム DNA 抽出収量と純度

Foregene Soil DNA Isolation Kit (DE-05511) はさまざまな供給源からの土壌サンプルを処理し、得られたゲノム DNA の量と純度を次の表に示します。
画像4例 2: 組織 RNA 抽出収量と純度

Animal Total RNA Isolation Kit (RE-03012) はさまざまな組織サンプルを処理し、得られた RNA の量と純度を以下の表に示します (マウス組織の場合)。
画像5ただし、OD 値を調べて終わりだと考えないでください。私が前に描いた重要なポイントに注意してください。

知らせ

断片化された核酸分子も吸光度で計算されます。RNA 内にゲノム DNA 残基があると仮定すると、OD 値は非常に高く見えますが、実際の RNA 濃度を決定することはできません。あなたのRNAが分解されているかどうかは明らかではないため、より正確に判断するための総合的な評価方法、つまりMIQEで言及されている核酸の完全性評価が依然として必要です。


投稿日時: 2022 年 1 月 13 日