2020年12月14日、英国が報じた。SARS-CoV-2 懸念変異種 (VOC)、系統 B.1.1.7、VOC 202012/01 または 20I/501Y.V1 とも呼ばれます。*B.1.1.7 の亜種は 9 月に出現したと推定されています2020年、急速に主流となった英国における SARS-CoV-2 変異種 (1)。B.1.1.7は米国を含む30カ国以上で検出されている。として2021 年 1 月 13 日の時点で、B.1.1.7 の約 76 件が感染しています。米国の12州で検出された。複数の証拠B.1.1.7 は、B.1.1.7 よりも効率的に送信されることを示します。他の SARS-CoV-2 変異体 (1–3)。モデル化された軌道米国におけるこの亜種は、2021 年初頭に急速な増加を示し、3月には主な亜種となる。増加したSARS-CoV-2の感染が逼迫した医療を脅かす可能性があるリソースが不足しているため、拡張されたより厳密な実装が必要です公衆衛生戦略 (4) の割合を増加させます。パンデミック制御には集団免疫が必要です。取る今すぐ感染を減らすための措置を講じることで、可能性を減らすことができるB.1.1.7 の影響を考慮し、ワクチン接種を増やすために重要な時間を確保するションの範囲。総合的に強化されたゲノム監視効果的な公衆への継続的なコンプライアンスと組み合わせるワクチン接種、物理的距離を含む健康対策、マスクの使用、手指衛生、隔離と検疫により、SARS-CoV-2（ウイルス）の蔓延を制限するために不可欠であるそれが2019年コロナウイルス感染症（COVID-19）を引き起こす。戦略的症状はないが感染リスクが高い人の検査SARS-CoV-2にさらされた人や感染症に罹患している人など避けられない公衆との頻繁な接触は、別の要因をもたらします。進行中の拡散を制限する機会。

世界的なゲノム監視と迅速なオープンソース共有ウイルスゲノム配列の解析により、ほぼリアルタイムでの処理が可能になりました進化する SARS-CoV-2 の検出、比較、追跡を制御するための公衆衛生の取り組みに情報を提供できる亜種パンデミック。一方、ウイルスゲノムにはいくつかの変異があり、現れては後退する、他の人は選択的アドバンを与えるかもしれない伝達性の向上を含めて、バリアントにタグ付けすることで、このような変異体は、他の流通している変異体を急速に支配する可能性があります。

パンデミックの初期に、以下を含む SARS-CoV-2 の変異種が出現しました。増加するスパイク (S) タンパク質の D614G 変異受容体結合力は多くの分野で急速に優勢になりました。地理的領域 (5、6)。2020 年の晩秋に、複数の国が検出したと報告しました。より効率的に拡散する SARS-CoV-2 の変異種。加えてB.1.1.7 亜種まで、注目すべき亜種には B.1.351 が含まれます。南アフリカで最初に発見され、最近特定された系統B.1.1.28 サブクレード (名前変更)「P.1」) 4人の旅行者から検出されました羽田（東京）での定期検査中にブラジルから空港。§ これらの変異体は一連の遺伝子変異を持っていますSタンパク質受容体結合ドメインを含む、これは宿主細胞のアンジオテンシンに結合するために不可欠です。酵素 2 (ACE-2) 受容体を変換してウイルスを促進するエントリ。証拠は、これらの細胞に他の変異が見つかったことを示唆しています。変異体は感染力の増加だけでなく、一部のリアルタイム診断のパフォーマンスにも影響する可能性があります逆転写–ポリメラーゼ連鎖反応 (RT-PCR)アッセイ¶ 中和抗体に対する感受性を低下させます(2,3,5–10)。最近の症例報告では、以下の最初の症例が記録されています。ブラジルにおける SARS-CoV-2 変異株による SARS-CoV-2 再感染E484K 変異が含まれていることが示されています**回復期血清およびモノクローナル抗体による中和を軽減するため抗体 (9,10)。

このレポートは、B.1.1.7 亜種の出現に焦点を当てています。米国では。2021 年 1 月 12 日の時点では、どちらもB.1.351 も P.1 亜種も検出されていません。アメリカ。新興の SARS-CoV-2 に関する情報については、懸念される亜種については、CDC が専用の Web ページを維持しています。新たな SARS-CoV-2 変異株に関する情報を提供します。††

 B.1.1.7 リネージ (20I/501Y.V1)

B.1.1.7 バリアントは S タンパク質に変異を持っています(N501Y) 受容体結合の立体構造に影響を与えるドメイン。この変異体には他に 13 個の B.1.1.7 系統定義変異 (表) があり、そのうちのいくつかは S タンパク質内にあります。位置 69 と 70 の欠失 (del69) を含む–70) それ他の SARS-CoV-2 変異体では自然発生的に進化しており、伝達率を高めるという仮説が立てられています(2,7)。削除69 位と 70 位で S 遺伝子標的不全 (SGTF) が引き起こされます。少なくとも 1 回の RT-PCR で–に基づいた診断アッセイ（すなわち、ThermoFisher Taq Path COVID-19 アッセイ、B.1.1.7 バリアントdel69 を使用した ant およびその他の亜種–70 マイナスを生み出すS 遺伝子ターゲットの結果と他の 2 つの結果が陽性ターゲット）;SGTFは英国で代理人を務めていますB.1.1.7 のケースを特定するため (1)。複数の証拠は、B.1.1.7 がより強力であることを示しています。他の SARS-CoV-2 と比較して効率的に感染する英国で流通している変異種。英国の地域B.1.1.7 シーケンスの割合が高く、流行が早かった他の領域よりも成長がみられ、SGTF との診断が増加同じ領域での非 SGTF 診断よりも迅速です。接触者のより高い割合が初発患者に感染していたB.1.1.7 感染の場合は、B.1.1.7 感染の初発患者による場合よりも他のバリアント (1、3)。亜種 B.1.1.7 は米国のパンを増加させる可能性があります今後数か月のデミックの軌跡。この効果を説明するには、次のようにします。シンプルな 2 つのバリアント コンパートメント モデルが開発されました。現在米国で流通しているすべてのウイルスに対する B.1.1.7 の有病率ウイルスは不明ですが、データに基づくと 0.5% 未満であると考えられています。検出された限られた数の症例と SGTF データ (8)。ためにモデルには、B.1.1.7 の蔓延が含まれる初期の仮定が含まれていました。全感染症の 0.5%、SARS-CoV-2 免疫過去の感染率10%–30%、時間とともに変化する再生産数値 (R t ) は 1.1 (緩和されるが透過率は増加)現在の変異株では0.9（伝播減少）、報告された発生率は1日あたり10万人当たり60例である。2021 年 1 月 1 日。これらの仮定は正確に表しているわけではありません。米国の単一の場所ではなく、一般化したものを示します。全国共通の状況。R t の変化獲得免疫とprevaの増加に起因する時間B.1.1.7 のレンスは、B.1.1.7 R t を仮定してモデル化されました。に基づいて、現在のバリアントの R t の 1.5 倍の定数になります。英国からの初期推定値 (1,3)。次に、ワクチン接種の潜在的な影響をモデル化しました。1回あたり100万回のワクチン投与が行われたと仮定すると、2021 年 1 月 1 日に始まる日、およびその 95% の免疫2回の投与を受けてから14日後に達成されました。具体的には、現在の変異株またはB.1.1.7 バリアントが想定されましたが、有効性と感染に対する防御期間は依然として不確実であり、これらは臨床試験の主要評価項目ではなかったため初回ワクチン用。このモデルでは、B.1.1.7 の蔓延は当初は低いですが、現在の亜種よりも感染力が高く、2021 年初頭に急成長し、主要なバリアントになる3月のアリ（図1）。電流の伝達かどうかバリアントは増加しているか (初期 R t = 1.1)、またはゆっくりと減少しています。(初期 R t = 0.9) 1 月、B.1.1.7 が大幅な変更を推進感染拡大の軌跡と指数関数的な新たな段階成長。感染症を防ぐワクチン接種により、初期の流行の軌道は変わらず、B.1.1.7は蔓延依然として発生します (図 2)。ただし、B.1.1.7 以降は、優勢な変異体であるため、その伝達は大幅に減少しました。近距離感染の減少に対するワクチン接種の効果期間は、送信が行われたシナリオで最大でした。すでに減少しています (初期 R t = 0.9) (図 2)。初期の取り組みユニバーサルやユニバーサルなどの B.1.1.7 亜種の拡散を制限できます。公衆衛生緩和戦略へのコンプライアンスの強化、より高い目標を達成するために、継続的なワクチン接種により多くの時間を与えることができます。集団レベルの免疫。

議論

現時点では臨床転帰に違いは知られていない記載されているSARS-CoV-2変異体に関連している。しかし、感染率が高くなると、より多くの症例が発生し、増加します臨床ケアを必要とする全体の人の数、さらに増加すでに逼迫した医療制度に負担を与え、そしてさらに多くの死者を出してしまう。継続的なゲノム監視B.1.1.7 のケースとその他のケースの出現を特定するため米国で懸念されている変異種は、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の公衆衛生への対応。SGTFの結果は確認できる潜在的な B.1.1.7 症例を特定するのに役立ちます配列決定により、症状を示さない優先バリアントを特定するSGTF はシーケンスベースの監視のみに依存しています。